中國地域遼闊，水資源豐富，不同地區(qū)的水質(zhì)差異很大。如果原水是井水，有機物負荷不會很大；如果是地表水(湖泊、河水或水庫水)，可能含有高水平的有機質(zhì)，有機質(zhì)的組成和數(shù)量可能受季節(jié)變化的影響；市政供水(自來水)通常用氯處理。在去除氯之前，微生物的含量相對較低，通常會抑制其生長。

通常情況下，純化水設備系統(tǒng)的配置方式根據(jù)地區(qū)和水源的不同而不同。純化水設備系統(tǒng)應根據(jù)不同的原水水質(zhì)條件進行分析計算，然后配置相應的組件，依次處理允許范圍內(nèi)的各項指標。

這里要提到的是，原水水質(zhì)要達到飲用水標準，才能作為制藥用水或純化水的初始用水。如果原水不符合飲用水標準，應先將原水處理至飲用水標準，再進一步處理成符合藥典要求的純凈水。純化水系統(tǒng)需要定期消毒和水質(zhì)監(jiān)測，以確保所有使用點的水符合藥典對純化水的要求。